Iki XVI a. vidurio susikūrė septynios vienuolijos (žymiausios – pranciškonų ir bernardinų), turinčios 18 vienuolynų – keturi įsikūrė Vilniuje, po du Kaune ir Gardine. Statomos puošnios vienuolynų bažnyčios su prabangiais altoriais, jose – daugybė paveikslų, skulptūrų bei freskų, o nuo XV a. pabaigos – ir vargonai. Visur, net ir toliausiai nuo vyskupijų centrų, kurtos parapijos ir statytos bažnyčios. XVI a. viduryje parapijų tinklas jau aprėpė beveik visą Lietuvą.